1. rész: Uzumaki Naruto megérkezik

Réges régen, Konoha Rejtett falujában a kilencfarkú rókadémon, más néven a Kyuubi pusztított. Shinobik harcoltak ellene. Egyikük feláldozta magát, hogy  a Kyuubit egy pecsét segítségével egy újszülött fiú testébe zárja. Ez a hős volt a 4. Hokage, azaz Yondaime. 12 évvel később egy Naruto nevű fiú megszökött az iskolából, később a tanára, Iruka elkapta, és visszavitte. Büntetésből mindenkinek meg kellett csinálni egy átváltozást. Naruto, a Sexy no Jutsu-t használta. Még aznap, Iruka és Naruto arról beszélgettek, hogy kik is azok a Hokagek. Kiderült az is, hogy  másnap lesz a vizsga, ahol Geninné válhatnak a tanulók. Másnap Narutonak nem sikerült átmennie a vizsgán. Iruka és Mizuki voltak a vizsgáztatók,  Mizuki át akarta engedni, csak Iruka nem. Narutot  nagyon bántotta, hogy csak egyedül Ő bukott meg.  Mizuki elmondta neki, hogy ha ellopja a Pecsétek Tekercsét, erősebb lesz, és Iruka biztosan átengedi a vizsgán. 

Naruto el is lopta a tekercset, ezért az egész falu Őt kereste. Iruka találta meg. Naruto, egy technikát tudott megtanulni, mégpedig a Kage Bunshin no Jutsu-t, egyfajta Árnyék-klón Technikát. Iruka érkezése után feltünt Mizuki is, és akkor derült ki, hogy Mizuki csak saját magának lopatta el a tekercset. Elmondta Narutonak, hogy  azért  utálja mindenki, mert benne van a Kyuubi (erről persze Naruto nem tudott). Narutot ugyanis utálták emiatt, és árvaságából adódóan egyedül kellett szembenéznie a dolgokkal egész életében. Csupán azt szerette volna, ha elismerik valamiben, de ez kiközösítése miatt nem valósulhatott meg.

Naruto elrohant. Iruka utána ment, hogy elvegye a tekercset, de Naruto megtámadta Irukát. Akkor derült ki, hogy Iruka, Mizuki volt átváltozva, Naruto pedig Iruka. Az igazi Naruto eközben elbújt. Hallotta, ahogy Iruka Őt dícséri, és elismeri létezését. Amikor Mizuki meg akarta ölni Irukát, Naruto megakadályozta, és a Kage Bunshin no Jutsu-val megverte Mizukit. Mivel a vizsgán a feladat a Kage Bunshin no Jutsu könnyebbik változata volt, ezért Iruka átengedte Narutot, és odaadta neki a fejpántját, ami azt jelképezi, hogy az ifjú tanonc elindulhat a ninjává válás rögös útján.

2. rész: Én vagyok Konohamaru

Naruto, egy Genin a regisztrációhoz szükséges igazolványképet csináltat magáról, elég vicces pózban. A 3. Hokage nem fogadja el a képet, újat akar csináltatni Narutoval. De  Naruto nem akarja, ezért használja a Sexy no Jutsut. Akkor jön be Konohamaru, aki mint kiderül, a Hokage unokája. Elesik a saját sáljában, és azt hiszi, Naruto gáncsolta el. Rátámad Narutora, de Naruto hiába magyarázza, hogy nem Ő volt, nem akarja elhinni a gyerek, ezért Naruto majdnem megbélyegzi a kissrácot az öklével.

Ekkor belép Ebisu, aki elmondja, hogy Konohamaru a Hokage unokája. A kölyök azt hiszi, hogy Naruto most megijed, és nem mer bemosni neki, de megteszi. Naruto tanítványául fogadja Konohamarut. Megkéri, hogy tanítsa meg neki a Sexy no Jutsut. Naruto tanítja, de Konohamaru mindig csak csúnya, kövér nővé tud átváltozni.

Ebisu nem tartja helyesnek, hogy Narutoval van a Hokage unokája, ezért követi Narutoékat. Később meg fogja Konohamarut, és haza akarja vinni, de Naruto a Kage Bunshin no Jutsut használja, és ezt kombinálja a Sexy no Jutsuval, evvel kifejleszt egy új technikát, mégpedig a Hárem no Jutsu-t. Ezzel a "technikával" kiüti Ebisut.

Később szóba kerül, hogy Konohamaru nevét a Harmadik Hokage adta, a „Konoha” szóból. Az is kiderül, hogy Konohamaru is Hokage akar lenni, de ezt Naruto ellenzi. Konohamaru ekkor azt mondja, hogy Naruto többé sem a mestere, sem a főnöke, hanem a legnagyobb riválisa. Naruto pedig visszamosolyog, és beleegyezik.

3. rész: Riválisok! Sasuke és Sakura

Naruto reggele, egy romlott tej ivásával kezdődik. Sakura és Ino versenyeznek, hogy ki ér előbb az Akadémiára, és ki ülhet Sasuke mellé. Egyszerre érnek be, ezért veszekednek. Naruto, amikor odaér, nagyon mérges, mert mindenki csak Sasukere figyel, ezért feláll az asztalra, ahol Sasuke ül, és farkasszemet néz vele. Az egyik alatta ülő véletlenül meglöki, amikor hátra fordul, így Naruto és Sasuke megcsókolják egymást. A lányok idegesek, főleg Sakura, mert Ő akarta adni Sasukenek az első csókot. Eközben a Jouninok a 3. Hokagevel beszélgetnek arról, kit hova oszthatnának be. A diákokhoz belép Iruka. Elmondja, ki kivel lesz majd egy csapatban. Ino és Sakura is Sasukevel akarnak lenni. Amikor a 7-es csapathoz érnek, Narutot Sakurához osztják be. Naruto nagyon örül, Sakura elátkozottnak érzi magát, de egy perc múlva kiderül, hogy Sasuket is oda osztották be. Sakura örül, Naruto nem.

Hinata, aki mindvégig szerelmes Narutoba, szomorú, mert nem lehet egy csapatban Narutoval. Jön a 8-as csapat: Ino, Shikamaru, és Chouji. Ino is elátkozottnak érzi magát, hogy pont ezekkel az emberekkel kell egy csapatban lennie. Hinata a 10-es csapat tagja lesz, Kibaval és Shinoval.  

A csapatok a Sensei-ükkel való találkozás előtt kapnak egy kis szabadidőt. Naruto bemegy Sasuke házába, és letámadja a mit sem sejtő Sasuke-t. "Sasuke" kijön, és odamegy Sakurához. Sakura azon gondolkodik, bárcsak Sasuke azt modnaná neki, hogy milyen szép a homloka. Akkor "Sasuke" odamegy, és a homlokát dicséri. Már éppen megcsókolnák egymást, amikor "Sasuke" hasa görcsölni kezd. Elrohan. Bemegy a WC-re. Ott kiderül, hogy mindvégig Naruto volt az, csak a Henge (Átváltozás) technikát használta azért, hogy Sakura közelében lehessen... Az igazi Sasuke, aki lekötözve feküdt a házban, később odament Sakurához. Sakura nagyon örült annak, hogy "visszatér a lovagja", de az igazi Sasuke idegesítőnek nevezi Sakurát. Ekkor gondol bele Sakura, hogy milyen rossz érzés lehetett Narutonak amikor ő ugyan ezt mondta rá. Hamarosan lejár az idő és jön a Sensei.

4. rész: Próba! Túlélő tréning

A 7-es csapat, Naruto, Sasuke, és Sakura a Sensei-t várják. Naruto megint bolondozik, ezért csapdát állít. A primitív csapda beválik. Sasuke nem képes elhinni, hogy ez a Jounin hogy sétálhatott bele egy ilyen kicsinyes csapdába. Sasuke, Naruto helyett kér elnézést.

Később négyen arról beszegetnek, kinek mi a célja, hobbija, stb. Mindezek előtt Kakashi Sensei bevág egy idióta bemutatkozást, amiből csak a neve derül ki. Naruto azt mondja, hogy  kedvence a ramen, és Hokage akar lenni. Sakura természetesen megint Sasukeről ábrándozik. Sasuke pedig nem óhajt válaszolni, de annyit mond, hogy meg akar ölni egy bizonyos személyt. Naruto gondolkodik, hogy vajon róla beszél-e.

Kakashi elmondja, hogy másnap mikor, és hol találkozzanak. A megbeszélt időpontra és helyre a három ifjú ninja tanonc el is megy, a konohai erdő szélére. Kakashi késik. Amikor odaér, elmondja a szabályokat. Bármilyen módon, csak vegyék el a nála lévő két csengőt. Pontosan délig van idejük.  Aki nem szerzi meg a csengőt, az nem kap ebédet és büntetésképpen kikötözve kell néznie, ahogy a többiek ebédelnek. Sakura rákérdez, hogy miért csak két csengő van, hiszen ők hárman vannak. Kakashi elmondja, hogy azért mert egy tanuló mindenképpen megbukik, szóval csak ketten mehetnek át a vizsgán.

Naruto egyből megtámadja Kakashit, de Kakashi könnyen kitér. Eközben a 3. Hokage elmondja Irukának, hogy Kakashi gyakorlatain még egyetlen tanuló sem ment át, ezért Iruka egy kicsit ideges lesz és elkezdi félteni Narutoékat.

A terepen, folytatódik a gyakorlat. Sasuke és Sakura elbújnak, Kakashi pedig a könnyen megtréfált Naruton használja az „Ezer év fájdalma" nevű, rögtönzött technikát, ez a technika szó szerint "hátsó szándékú" xD

A következő próbálkozásként, Naruto, egy Kage Bunshnnal lefogja Kakashit. Ám Kakashi egymás ellen uszítja a klónokat.  Naruto meglát a földön egy csengőt. Fel akarja venni, de mivel az egy csapda, ezért egy kötél és egy fa közreműködésével, fejjel lefelé lógva látja viszont a világot. Sasuke, ekkor figyel fel a megfelelő alkalomra, és néhány Kunaival eltalálja Kakashi fejét, aki eszméletét elvesztve zuhan a földre.

5. rész: Bukás? Kakashi befejezés

Kakashit Sasuke eltalálja a Kunaikkal, de Kakashi "farönkké változik", a Henge no Jutsu-t használta. Sasuke elfut, keresi Kakashit.

Eközben Sakura, Sasuket látja, véresen, Kunaikkal a testében, amint a segítségét kéri. A lány elájul, de ez csak Kakashi egy Genjutsu-ja (illúzió technikája) volt.

Sasuke megtalálja Kakashit, és kemény harcba kezdenek. Végül Sasuke a földben végzi, csak a feje látszik ki. Sakura ezt is meglátja, megint elájul.

Nagy nehezen Naruto kiszabadul a csapdából, és meglátja az ebédet, természetesen egyből odamegy, hogy megegye, de Kakashi meglátja, és a fához kötözi Narutot. Sasuke kijön a földből, Sakura felébred. Mind visszamennek a kiinduló helyre. Kapnak ebédet. Kakashi a lelkükre köti, hogy ne merészeljenek Narutonak adni belőle, mert Naruto kérdés nélkül megette volna az egészet társai elől. Természetesen azt is bejelenti, hogy megbuktak a vizsgán, mivel nem tudták elvenni a csengőt és megbuktak csapatként is. Naruto saját érdekeit nézi, és csak Sakurával foglalkozik. Sakura nem törődik Narutoval és csak Sasuket félti. Sasuke pedig nem törődik senkivel, és azt hiszi magáról hogy ő a legjobb, a többiek csak hátráltatnák a munkában. Kakashi ezeket a tényeket felsorolja és elmondja hogy egy ninja küldetés során egy csapatnak mindenáron együtt kell működnie, mert sokszor adódik olyan, hogy csak egymásra lehet támaszkodni.

Kakashi egy pillanatra elmegy, hogy Narutoék meg tudják emészteni az imént mondottakat. Sakura ad Narutonak ételt, Sasuke "fedezi". Hirtelen Kakashi előugrik, erre az ifjú tanoncok megijednek. Sasukeék megfogadják, hogy mindenáron összetartanak, bármi történjék is. Ezért a kijelentésért Kakashi bejelenti, hogy átmentek a vizsgán. Mától fogva hivatalosan is Geninek

6. rész: Szuper kirándulás a Víz országába

Kakashi csapatának feladata, hogy elkapjanak egy elszökött macskát. Amikor Naruto elfogja, és visszamennek a Hokagehez, Naruto elégedetlenkedni kezd, amiért mindig csak ilyen könnyű, és gyenge küldetéseket kapnak. A Hokage akkor avatja be a küldetési szintekbe.

Naruto folyamatos engedetlensége és puffogása miatt, kapnak egy C-szintű küldetést. Naruto nagyon örül, azt hiszi egy hercegnőt, vagy híres embert kell kísérni. De "csak" egy öreg embert, Tazunát, a Hullám Vidékének fontos emberét, egy híd építőjét kell elkísérni.

Amikor kiérnek Konohából, Naruto természetesen biztosítja Tazunát arról, hogy mellette nem kell félnie, hiszen ő a legjobb ninja a világon xD. Kakashi elmeséli a faluk és országok jellegzetességeit. Útjuk során a Köd faluból származó Démon Fivérek támadják meg Őket.  Kakashit megfogják, és összezúzzák. Az ifjú ninják azt hiszik Kakashi meghalt. Narutot megtámadják a Démon fivérek, de Sasuke megmenti. Emiatt Naruto nagyon ideges. Kakashi mégsem halt meg, hisz már ismerjük a Henge no Jutsu technikát, azaz kicserélte a testét egy másik tárgyra, szóval jelen esetben, farönkké változott.

Naruto kezébe méreg kerül az egyik fivér által. Sasuke piszkálás képpen, oda mondja Narutonak, hogy „Minden rendben, félős cica?”  Naruto nagyon ideges. Ezért kivágja a saját kezéből a mérget, hogy megmutassa, milyen bátor és erős. Elmondta, hogy napokig gyakorolt, csakhogy jó ninja lehessen. Kakashi bekötözi a kezét. Az epizód végén még bepillantást nyerhetünk egy helyre, ahol egy Zabuza nevű férfit bíznak meg Tazuna megölésével.